MitoTracker Green FM是線粒體綠色熒光染料，這種染料定位于線粒體的能力看起來不受線粒體膜電位影響。該染料可以對(duì)活細(xì)胞進(jìn)行染色，但是乙醛固定后不能穩(wěn)定保存。MitoTracker Green FM也可以用來對(duì)固定細(xì)胞的線粒體進(jìn)行染色。
MitoTracker Red CM-H₂XRos是MitoTracker Red (M-7512)的非熒光還原態(tài)，在氧化時(shí)才會(huì)發(fā)出熒光。該染料也可以對(duì)活細(xì)胞線粒體進(jìn)行染色并且其積累取決于膜電位。乙醛固定后，該染料可穩(wěn)定保存。
MitoTracker® Deep Red FM是一種遠(yuǎn)紅熒光染料（吸收波長(zhǎng)/發(fā)射波長(zhǎng)約為640/662 nm），用于對(duì)活細(xì)胞線粒體進(jìn)行染色，并且該染料的積累取決于膜電位。乙醛固定后，該染料可穩(wěn)定保存。
MitoTracker Red CMXRos是一種紅色熒光染料，用于對(duì)活細(xì)胞線粒體進(jìn)行染色，并且該染料的積累取決于膜電位。乙醛固定后，該染料可穩(wěn)定保存。